Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ5

SGMS1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1Q86VZ5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGMS1Q86VZ5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGMS1Q86VZ5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms