Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLRX1Q86UT6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRX1Q86UT6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms