Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms