Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA2D4Q7Z3S7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms