Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q7L0L9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q7L0L9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q7L0L9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q7L0L9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q7L0L9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q7L0L9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q7L0L9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q7L0L9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q7L0L9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q7L0L9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q7L0L9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q7L0L9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q7L0L9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q7L0L9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q7L0L9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q7L0L9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q7L0L9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q7L0L9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q7L0L9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q7L0L9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q7L0L9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms