Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms