Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCIMPQ6UWF3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 321.9 ms