Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms