Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.3 ms