Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NANOGP8Q6NSW7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms