Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCSD1Q6JBY9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms