Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
WSCD1Q658N2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WSCD1Q658N2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms