Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF38BQ5VTL8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms