Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms