Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDK2Q58EX2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms