Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HSD17B12Q53GQ0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms