Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SBK1Q52WX2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SBK1Q52WX2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms