Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms