Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTXN3Q4LDR2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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