Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SVEP1Q4LDE5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms