Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBRG1Q3YBR2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms