Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BBS9Q3SYG4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms