Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TTLL9Q3SXZ7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TTLL9Q3SXZ7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms