Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP41Q3LFD5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP41Q3LFD5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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