Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
EDRF1Q3B7T1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms