Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRFIP1Q32MZ4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRFIP1Q32MZ4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms