Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC57Q2TAC2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms