Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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LTC4SQ16873 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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LTC4SQ16873 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTC4SQ16873 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTC4SQ16873 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTC4SQ16873 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTC4SQ16873 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTC4SQ16873 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTC4SQ16873 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTC4SQ16873 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTC4SQ16873 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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