Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CLPPQ16740 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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