Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HIST3H3Q16695 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HIST3H3Q16695 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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