Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA4Q16363 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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