Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNGA3Q16281 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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