Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
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