Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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