Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRIP13Q15645 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRIP13Q15645 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms