Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GAPVD1Q14C86 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GAPVD1Q14C86 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms