Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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RAB39AQ14964 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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RAB39AQ14964 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB39AQ14964 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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RAB39AQ14964 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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RAB39AQ14964 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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RAB39AQ14964 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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RAB39AQ14964 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB39AQ14964 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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