Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms