Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BECN1Q14457 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BECN1Q14457 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
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