Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBFBQ13951 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms