Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CUL4BQ13620 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms