Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MSLNQ13421 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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