Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE3BQ13370 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
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