Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RIGQ13278 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RIGQ13278 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RIGQ13278 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RIGQ13278 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RIGQ13278 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RIGQ13278 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RIGQ13278 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RIGQ13278 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RIGQ13278 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RIGQ13278 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RIGQ13278 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RIGQ13278 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RIGQ13278 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RIGQ13278 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RIGQ13278 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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