Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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NR1H3Q13133 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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NR1H3Q13133 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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NR1H3Q13133 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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NR1H3Q13133 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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NR1H3Q13133 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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NR1H3Q13133 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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NR1H3Q13133 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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NR1H3Q13133 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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NR1H3Q13133 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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NR1H3Q13133 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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NR1H3Q13133 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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NR1H3Q13133 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NR1H3Q13133 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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