Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHAF1AQ13111 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
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