Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK3Q13003 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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