Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFIAQ12857 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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