Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPTFQ12830 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPTFQ12830 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms