Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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SMARCB1Q12824 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMARCB1Q12824 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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